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代理进口业务中，出现进项税差的情况，需要根据具体原因来采取相应的解决措施。首先，要核对进口货物的报关单、增值税专用缴款书等凭证，确认进项税额的准确性。如果是因为报关单上的商品信息与实际进口货物不符，应及时与报关行沟通，进行更正。
其次，检查代理合同中关于税费的约定。如果代理方未按照合同约定正确计算和缴纳税费，应要求其承担相应的责任并进行调整。
最后，若存在税率适用错误的问题，需向税务机关咨询，按照规定进行调整和补缴税款。
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可以向税务机关咨询，了解具体的补缴流程和要求，按照规定进行操作。
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仔细核对相关凭证和数据，找出进项税差的具体原因，再针对性地解决。
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如果是计算错误导致的，重新计算并及时补缴差额部分的税款。
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与代理方共同梳理业务流程，查找问题所在，协商解决方案。
