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根据中国税法，企业必须按照税法规定的税种和税率缴纳税款。而国税定额是指国家税务局按照税法规定，对某些企业按照行业、地区等因素确定的固定缴税标准。在一定程度上，国税定额的缴纳方式可以简化纳税流程并减少缴税成本。
但是，工厂不能选择自己缴纳国税定额而不缴纳增值税。根据中华人民共和国增值税暂行条例，纳税人（包括企业）应当根据其销售货物、劳务的实际情况计算应纳税额，确认应纳税额后再缴纳增值税。这也是外贸企业申请退税的前提条件之一。
因此，如果工厂不缴纳增值税，外贸企业就无法享受退税政策，这会给企业带来经济损失。建议您与这家工厂再次沟通，确认其纳税方式是否符合中国税法要求，并据此做出合理决策。
