针对您的问题,我提供以下解答:
1. 关于付款的问题,建议您可以和两个工厂建立支付清晰的合作协议,并且了解两个工厂的付款方式。您可以选择采用先向染色厂支付原材料成本,确定好成衣成本后再支付成衣成本给染色厂,让染色厂向坯布厂支付原材料成本的方式,这样可以避免两个工厂之间的支付问题。但是支付方式需要根据实际情况而定,您需要与两个工厂协商并达成一致。
2. 关于税负的问题,如果您将坯布直接提供给染色厂,则只有染色厂可以申请上海退税。如果染色厂接受坯布厂的发票,则染色厂和坯布厂都可以申请上海退税。坯布厂申请退税时,需要提供销售商的贸易合同和付款凭证等证明文件,证明坯布已经销售到您这里,并提供申请退税时的增值税发票。染色厂可以向坯布厂索取增值税发票,然后再和自己的发票相对应,申请退税。如果坯布厂因为卖给染色厂没有开具增值税发票,那么染色厂只能申请自己的退税。
希望以上回答能对您有所帮助,如还有问题请随时咨询。