亮点一：自主改革
《条例》规定，上海自贸试验区建设要坚持“自主改革”的指导思想，努力聚焦制度创新的重点领域和关键环节，积极运用现行法律制度和政策资源，改革妨碍制度创新的体制、机制，不断激发制度创新的主动性、积极性。
亮点二：法无禁止皆可为
《条例》在总则中特别规定，凡是法律、法规、规章未禁止的事项，鼓励公民、法人和其他组织在自贸试验区开展改革创新。
亮点三：负面清单管理模式
《条例》明确上海自贸区根据国家要求，实行外商投资准入前国民待遇加负面清单管理模式。
亮点四：企业注册便利化
《条例》明确自贸试验区建立企业准入单一窗口工作机制，还明确注册资本可依法实行认缴登记制。
亮点五：海关和检验检疫监管制度改革
《条例》规定要按照“一线放开、二线安全高效管住、区内流转自由”的原则，积极开展海关和检验检疫监管等方面制度的创新。
亮点六：国际贸易单一窗口
《条例》规定在试验区建设国际贸易单一窗口。
亮点七：五大金融创新
《条例》规定了五大金融创新关键点：创新有利于风险管理的账户体系；促进投融资汇兑便利；人民币跨境使用；推动利率市场化体系建设；建立与自贸试验区发展需求相适应的外汇管理体制。
亮点八：六大事中事后监管制度
《条例》规定了六项事中事后综合监管的主要制度：国家安全审查机制；反垄断工作机制；加强信用管理；建立企业年度报告公示和经营异常名录制度；建立监管信息共享和综合执法制度；建立社会力量参与市场监督制度。
亮点九：“一公平四保护”
《条例》对国际通行的“一公平四保护”进行了专门规定，即维护公平竞争、加强投资者权益保护、加强劳动者权益保护、加强环境保护、加强知识产权保护。
亮点十：进一步增强透明度
《条例》从制定并公布权力清单、抽象行为接受公众评论、建立行政异议制度、建立信息发布机制等四个方面进行了规范。（上海自贸区）
